В эпоху Бакумацу, сердца молодых людей полыхали от тревоги за будущее их страны. Синсаку Такасуги, наёмник из Тёсю, и его верный товарищ Когоро Кацура отправляются на государственный корабль в поисках загадочного "хронометра", способного управлять временем. Они боятся, что правительство может использовать его в своих корыстных целях. Чтобы предотвратить потерю такой мощной силы, Синсаку решает уничтожить артефакт. Однако, только достав его в руки, он неожиданно теряет его, и теперь его и Когоро придется охотиться за вором, который украл "хронометр", до резиденции правительства в Киото.
Однако, по приезду в столицу, они обнаруживают, что правительство свергнуто, и землями теперь правит божество Сусаноо. Улицы и люди в Киото сильно отличаются от того, что помнят Синсаку и Когоро. Времена изменились, но их миссия остается неизменной – они решают "перезапустить" время и спасти свой народ от ужасных сил, которые пытаются захватить его.