Космический линкор Ямато

В 2199 году Земля подвергается нападению инопланетной расы из Империи Гамилус, возглавляемой Лордом Деслером. Их стремление - завоевать планету. Они используют радиацию, свойственную их родной атмосфере, и обстреливают поверхность Земли радиоактивными астероидами. Результатом становится невозможность жизни для людей на поверхности планеты, и человечество вынуждено спрятаться под землю.

Однако и подземные города не могут избежать разрушительного влияния радиации. В это время на Марсе происходит крушение космического корабля другой цивилизации. На борту находятся Сусуму Кодай и Дайсукэ Сима, которые обнаруживают погибшую девушку с посланием от правительницы планеты Искандер. Старший Искандар, в расшифрованном послании, предлагает помощь землянам в борьбе с космической угрозой, приглашая их на свою родную планету. Там находится устройство, способное очистить поверхность Земли от радиоактивного загрязнения. К посланию прилагается инструкция для создания мощного космического двигателя.