В южно-азиатской стране Газ-Соника, уже на протяжении двенадцати лет, бушует кровопролитная гражданская война между королевской армией и повстанцами. Но самое интересное - никто уже не помнит, как именно все началось. На фоне этого хаоса и разрушений, на поле боя проявляет свои навыки опытная наемница, известная под прозвищем Мадлакс. Казалось бы, она не имеет никакого отношения к противоборствующим сторонам, но ее присутствие меняет ход событий в этой кровавой войне.
В то же время, в спокойной европейской стране Нафреция, девушка по имени Маргарет Бёртон ведет обычную жизнь. Она только что восстановила свою память после амнезии, которая постигла ее двенадцать лет назад. Мадлакс и Маргарет - две совершенно разные личности, живущие в разных уголках мира. Однако, они связаны загадочной древней книгой, написанной на непонятном языке, за которой охотится таинственная организация под названием "Энфант". Встреча этих двух девушек проливает свет на прошлые события, открывая истину, которую не каждый может вынести на свет. Теперь им предстоит раскрыть тайны своего прошлого и столкнуться с опасностями, которые они и не подозревали раньше.